El Rayo Sanluqueño tendrá un equipo filial esta próxima temporada. Competirá en la Tercera Andaluza, competición del que se desconoce todavía el calendario.
El entrenador del Rayo Sanluqueño B será Yaya, que tendrá una plantilla de jugadores jóvenes.
Además del primer equipo y del filial, el Rayo Sanluqueño contará con un conjunto cadete y con un juvenil. El cadete será dirigido por Dani Villa y el juvenil por Javier Rosa. Los cuatro equipos del Rayo Sanluqueño suponen 100 jugadores federados para afrontar la temporada 2017-2018.
El primer equipo actuará como local en El Picacho. El filial, el juvenil y el cadete están pendientes de saber donde jugarán cuando jueguen en casa. Mientras tanto, el Rayo Sanluqueño prepara el inicio de la temporada 2017-2018.